神户大学的历史以 1902年神户高等商业学校建校为起点。 校旗1869年神户病院开院并于 1876年开设医学所，1874年兵库县师范传习所开学。 1902年神户高等商业学校建校， 1929年改称神户商业大学。 1944年改称神户经济大学。 1945年之后，以上诸源相继合流，于1949正式称为神户大学。
神户大学以其悠久的历史，一流的教学质量，被公认为日本顶尖的老牌院校，其优异的教学和科研成果在世界都享有极高的声誉。
神户大学处于国际城市神户所拥有的开放的环境之中，从事着提高人性、创造性、国际性、专业性的教育。 并且，神户大学不仅在在人文社会类中的研究处于领先地位、在自然类、生命和医学类的任何学术领域都也进行着世界最高水平的学术研究。
神户大学以其悠久的历史、雄厚的师资力量、一流的教学质量，被公认为日本顶尖的老牌院校，并和七所旧帝国大学(东京大学、京都大学、大阪大学、东北大学、名古屋大学、九州大学、北海道大学)、一桥大学、东京工业大学合称“旧帝一工神”，这10所大学代表着日本国立大学的高水平，并以其优异的教学和科研享有极高的声誉。2012年，神户大学的毕业生山中伸弥获得了当年的诺贝尔医学或生理学奖，这也为神大的科研成果再添一彩。
神户大学是声望仅次于旧帝国大学的旧三商大之一，是日本经营学大学院、商管学术期刊的发祥地。其校友涵盖1名日本首相、1名诺贝尔医学奖得主、近30名国会议员等。
