东京大学部分科系最早可以溯源到灵元天皇时期，学校主体由“东京开成学校”与“东京医学校”在明治维新期间合并改制而成。作为资本主义文明浪潮冲击下的直接产物，东京大学有着举足轻重的历史性地位，它培养了包括1名菲尔兹奖得主、6名沃尔夫奖得主、8名诺贝尔奖得主、16位日本首相、21位(帝国)国会议长在内的一大批学术名家、工商巨子、政经菁英，是日本重要的政商、文化阵地，是日本最高学术殿堂、是亚洲乃至世界最顶尖的科研教育机构之一。

京都大学前身是1869年5月建立的第三高等学校。1897年利用甲午战争的中国赔款，高校的法学部及工学部组成京都帝国大学，高校改设大学预科。同年设置理工科大学。1899年设置法科大学以及医科大学。1906年设置文科大学。(帝国大学不设学院，下设分科大学)大约20年后这些分科大学改称学部(学院之意)。在第二次世界大战后的学制改革中，第三高等学校剩余的部分(大学预科)并入京都大学。

大阪大学起源于1724年设立的汉学塾怀德堂和1838年由绪方洪庵设立的兰学塾适塾。作为后者的发展在1931年创设了由医学部和理学部组成的大阪帝国大学。作为日本国内的旧制帝国大学的第六所，最初以医学部和理学部开始，创立不久就已“理科的阪大”而崭露头角。。。

一桥大学为明治六大教育家中之二人森有礼及福泽谕吉于1875年(明治8年)所创立的商法讲习所为起源，日本最古老的社会科学系大学。之后，在第二次世界大战发生以前则为“东京商科大学”，作为日本第一所国立单科大学而专门于商学领域中耕耘。

东京工业大学的前身是由以培养工学方面专业人才为办学目的的“东京职工学校”发展而来(1881年5月26日建校)，第一任校长是正木退藏。为了达到迅速追赶西方科技的目的，日本明治政府希望通过建立这所学校来培养更多的近代化技术工人和工程师。

东北大学是所中国人民熟悉的一所大学，我国伟大文学家鲁迅先生，以及数学家苏步青教授曾就读过该校。该校有优良的学风和校风，归结起来有三点。 1.东北大学向来有着“尊重研究”的光荣传统，并且代代相传，各部门都十分重视科学研究，成果累累，留下了光辉的业绩。